EPIDEMIOLOGIA BASEADA EM ESGOTO COMO FERRAMENTA DE SAÚDE ÚNICA: VIGILÂNCIA DO SARS-COV-2 E DA RESISTÊNCIA ANTIMICROBIANA EM Escherichia coli E Klebsiella pneumoniae.
Publicado: 06/08/2026 - 12:34
Última modificação: 13/08/2026 - 09:05
Convidamos a todos para a Defesa da Tese de Doutorado do discente do nosso programa, José Eduardo Machado Barroso.
A defesa pública ocorrerá no dia 28/08/2026 às 14h:00, no formato híbrido, presencial no Anfiteatro do Hospital Veterinário/UFU, Campus Umuarama e por videoconferência com acesso através do link:
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Será apresentado o trabalho com o título:
EPIDEMIOLOGIA BASEADA EM ESGOTO COMO FERRAMENTA DE SAÚDE ÚNICA: VIGILÂNCIA DO SARS-COV-2 E DA RESISTÊNCIA ANTIMICROBIANA EM Escherichia coli E Klebsiella pneumoniae.
Resumo: A Epidemiologia Baseada em Esgoto (EBE) consolidou-se como uma ferramenta estratégica de vigilância em saúde, permitindo o monitoramento não invasivo de patógenos e a avaliação da saúde comunitária sob a ótica da Saúde Única (One Health). A presente tese teve como objetivo investigar a dinâmica de circulação do SARS-CoV-2 e caracterizar o perfil de resistência antimicrobiana de Escherichia coli e Klebsiella pneumoniae em esgoto bruto no município de Uberlândia-MG. O estudo foi dividido em dois eixos de vigilância: virológica e bacteriana. No primeiro eixo, realizou-se a quantificação da carga viral de SARS-CoV-2 e a identificação genômica de variantes ao longo dos períodos pandêmico e pós-pandêmico, correlacionando os dados ambientais com indicadores clínicos de notificação de casos e óbitos. Os resultados evidenciaram a eficácia da EBE como sistema de alerta precoce, demonstrando concordância entre a carga viral nos efluentes e as ondas epidemiológicas da COVID-19. No segundo eixo, seis isolados de E. coli e três de K. pneumoniae recuperados da Estação de Tratamento de Esgoto Uberabinha foram caracterizados quanto à suscetibilidade antimicrobiana e ao genoma completo, incluindo sequence types, genes e mutações de resistência, fatores de virulência e replicons plasmidiais; as mesmas amostras de esgoto foram submetidas à metagenômica direcionada por enriquecimento de alvos, ampliando a detecção de táxons do grupo ESKAPEE e de determinantes de resistência não recuperados pelo cultivo. As análises revelaram uma elevada prevalência de cepas multirresistentes (MDR), incluindo a detecção de mecanismos de resistência críticos (blaCTX-M, blaKPC-2, blaNDM, blaVIM), evidenciando complementaridade entre cultivo, sequenciamento genômico e metagenômica direcionada. Conclui-se que a vigilância integrada de esgoto bruto é essencial para a saúde pública, fornecendo dados robustos para a gestão de surtos virais e para o controle da disseminação da resistência bacteriana sob a perspectiva de Uma Só Saúde.
Palavras-chave: Equino; Gastroscopia; Jejum alimentar; Eritromicina; Esvaziamento gástrico
Abstract: Wastewater-Based Epidemiology (WBE) has established itself as a strategic tool for health surveillance, enabling non-invasive pathogen monitoring and community health assessment from a One Health perspective. This thesis aimed to investigate the circulation dynamics of SARS-CoV-2 and characterize the antimicrobial resistance profile of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in raw sewage in the municipality of Uberlândia-MG, Brazil. The study was divided into two surveillance axes: virological and bacterial. In the first axis, SARS-CoV-2 viral load quantification and genomic identification of variants were performed throughout the pandemic and post-pandemic periods, correlating environmental data with clinical indicators of reported cases and deaths. The results evidenced the effectiveness of WBE as an early warning system, demonstrating concordance between viral load in effluents and the epidemiological waves of COVID-19. In the second axis, six E. coli and three K. pneumoniae isolates recovered from the Uberabinha wastewater treatment plant were characterized for antimicrobial susceptibility and whole-genome sequence data, including sequence types, resistance genes and mutations, virulence factors and plasmid replicons; the same sewage samples were subjected to targeted enrichment metagenomics, expanding the detection of ESKAPEE taxa and resistance determinants not recovered by culture. The analyses revealed a high prevalence of multidrug-resistant (MDR) strains, including the detection of critical resistance mechanisms (blaCTX-M, blaKPC-2, blaNDM, blaVIM), evidencing complementarity between culture, genomic sequencing and targeted metagenomics. It is concluded that integrated raw sewage surveillance is essential for public health, providing robust data for managing viral outbreaks and controlling the spread of bacterial resistance from a One Health perspective.
Keywords: Equine; Gastroscopy; Feed restric2on; Erythromycin. Gastric emptying